Raiderr, tRiMe:o0O, флеш-объекты всегда находятся выше всего!
По дефолту - да.
wmode="transparent" у EMBED разрешает перекрывать флеш. Или это в параметрах <param name="wmode" value="transparent">
---- В конкретном случаи плеер на другом сайте и изменить этот параметр врятли удастся. Попробуйте поставить z-index:-999 !important; но это врятли поможет.